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分子實驗室如何選擇核酸提取儀?
隨著分子生物學技術的快速發展,以核酸雜交、核酸擴增和核酸序列分析為代表的分子診斷和檢測技術的重要作用日益突出。樣品預處理占整個分析過程的60%,90%的檢測誤差發生在預處理環節。核酸提取是分子診斷實驗的“第一步”,也是最關鍵的一步。獲得的核酸質量直接影響下游分子生物學實驗的成敗。
國內二級醫院、三級醫院、疾病預防控制中心、第三方檢測等符合國家新冠肺炎檢測要求的機構將繼續接收大量新冠肺炎檢測需求。與此同時,很多省份都出臺了政策文件,在全省范圍內擴建醫院,尤其是二級醫院。面對市場上各種各樣的產品,如何選擇一臺合適的自動核酸提取機需要仔細分析。
1.核酸提取原則
1.1
使用離心柱法的儀器
離心柱法核酸提取 instrument主要采用離心機和自動移液裝置相結合的方法。通量一般為1-12個樣本,操作時間與人工提取相差無幾,無法提高實際工作效率。而且價格昂貴,不同類型儀器的耗材不能通用,只適合資金充足的大型實驗室。
1.2
帶有磁珠法的儀器
以磁珠為載體,基于磁珠在高鹽低PH值下吸附核酸,在低鹽高PH值下與核酸分離的原理,通過移動磁珠或轉移液體即可實現核酸提取純化的全過程。由于其原理的獨特性,可設計成多種通量,單管或8-96個樣品即可提取,操作簡單快捷。一個批次的提取時間為9-40min(不同廠家的樣品不同),大大提高了實驗效率,成本低,可以在不同的實驗室使用。是目前市場上的主流儀器。
磁珠法自動核酸提取儀器分為磁棒法和吸引法。
1.2.1
抽吸法
顧名思義,吸樣是通過自動移液裝置進行的。磁鐵分為底部和側面兩種裝置。抽吸法的問題是,為了在不去除磁珠的情況下去除廢液,移液管不能離磁珠太近,以防磁珠隨廢液一起被去除。1)底部帶有磁鐵的裝置,由于磁珠被磁鐵吸附在底部,使得漂洗液無法完全去除,殘留的漂洗液中的鹽和乙醇會影響后續的洗脫效率和PCR成功率;2)側面有磁鐵的裝置會有較少的殘液,但洗脫效率也不好。要靠DNA自己溶解到洗脫緩沖液中,除非超過半小時,所以有的96自動核酸提取工作站提取一輪需要150分鐘,32磁棒法同樣時間可以提取五輪。
1.2.2
磁棒法核酸提取儀器
通常,有8、16、32和96個通量通道。磁棒只是帶走磁珠,轉移到下一步對應的反應孔中。此外,磁棒法提取儀器應具有更完善的功能,如加熱,每個加熱罐應具有獨立的溫度控制,以便設置不同的加熱、裂解和洗脫溫度。還有一點很重要,驅動磁棒的電機要能帶動磁棒快速混合攪拌液體。
磁棒法核酸提取米混合法
1)搖動混合:通過磁棒的上下振動來混合磁珠和核酸是目前市場上的主流方法。
2)旋轉混合:通過磁棒的旋轉來混合磁珠和核酸。與傳統的振蕩混合技術相比,氣溶膠產量大大減少了50%以上。交叉污染帶來的假陽性風險得到更有效的控制,進一步保證了實驗結果的準確性。此外,旋轉混合法可以限度地保留DNA的長鏈,減少核酸的機械斷裂,提高后續檢測的靈敏度。
核酸提取試劑盒試劑及其操作步驟
買了儀器后,一定要考慮配套試劑的后續使用問題:
1)配套試劑是否齊全。不同樣品類型提取套件的產品鏈是否完整?
2)配套試劑是否預包裝。無包裝試劑需要實驗室工作人員用移液器添加裂解液、洗滌液、洗脫液等試劑,不減少人工操作時間;
3)除了在提取前加入樣品。需要加蛋白酶K嗎?因為有些公司還沒有掌握將蛋白酶K預包裝在裂解液中并在室溫下保存的技術,蛋白酶K需要在-20℃下單獨保存,所以需要立即添加。每個樣品多加一步蛋白酶K,K,96個樣品的作用時間增加約10~15min。
4)匹配試劑的保存溫度。有些廠家的提取試劑需要在2-8℃下運輸和儲存。冷鏈運輸增加了運輸成本,儲存需要在冰箱里。然而,預包裝的提取試劑具有較大的體積,并且當像新冠肺炎那樣大量使用時,冰箱中沒有足夠的存儲空間來存放一段時間的試劑。
5)提取后的擴增效率。提取核酸時,觀察磁珠殘留率,檢查提取核酸的質量!
深孔板
儀器使用的便利性
應該考慮使用儀器的方便性。中文界面有利于學習如何使用儀器和編輯程序,減少新操作人員的誤操作和實驗失敗的風險。
公司售后服務體系
作為醫療器械,簡單的實驗關系到診斷,甚至關系到成千上萬人的生命安全。儀器廠商的售后團隊是購買儀器時要考慮的軟實力,強大、經驗豐富的售后支持團隊是購買儀器的重要后盾。售后團隊需要做的是:
1)負責處理訓練實驗中的常見問題和簡單故障;
2)負責培訓設備的日常維護;
3)提供臨床常見PCR檢測項目的技術數據;
4)安排技術人員對全院醫務人員進行集中科普講座;
5)接到服務電話后2小時內響應,形成解決方案,技術支持人員及時上門解決;
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